IDEAS home Printed from https://ideas.repec.org/a/bjw/techvi/v16y2021i1p112-125.html
   My bibliography  Save this article

Bước đầu xây dựng bộ chỉ thị SSR của DNA dưa leo và nhiệt độ bắt cặp tối ưu của các mồi SSR cho phản ứng PCR

Author

Listed:
  • Lương Hiếu Ngân

    (Nghiên cứu tự do, Thành phố Hồ Chí Minh, Việt Nam)

  • Hồ Thị Bích Phượng

    (Nghiên cứu tự do, Thành phố Hồ Chí Minh, Việt Nam)

  • Nguyễn Như Thành

    (Công ty TNHH Hạt giống Tân Lộc Phát, Việt Nam)

  • Hoàng Thị Thuỳ

    (Công ty TNHH Hạt giống Tân Lộc Phát, Việt Nam)

  • Cao Tiến Sang

    (Công ty TNHH Hạt giống Tân Lộc Phát, Việt Nam)

  • Vũ Quốc Trưởng

    (Công ty TNHH Hạt giống Tân Lộc Phát, Việt Nam)

  • Linh Thị Trúc Lê

    (Trường Đại Học Mở Thành phố Hồ Chí Minh, Việt Nam)

  • Lê Thị Kính

    (Trường Đại Học Mở Thành phố Hồ Chí Minh, Việt Nam)

Abstract

Bản đồ liên kết phân tử với mật độ chỉ thị cao cần được xác định trước khi thực hiện chọn giống bằng DNA marker trong đó các chỉ thị này có sự liên kết chặt với các tính trạng quan tâm. SSR (Simple Sequence Repeat - Trình tự lặp lại đơn giản) là một marker phân tử được dùng để xây dựng bản dồ liên kết phân tử và có thể phân biệt được các dạng dị hợp và đồng hợp của gene. Mục tiêu của nghiên cứu là xây dựng bộ chỉ thị SSR có liên kết với các tính trạng quan trọng trong chọn giống dưa leo và xác định được điều kiện tối ưu cho phản ứng PCR khuyếch đại DNA dưa leo từ những SSR này. Thực hiện khai thác in silico để xây dựng bộ dữ liệu SSR. Tối ưu hoá phản ứng PCR bằng chạy gradient nhiệt độ cho các mồi SSR. Chúng tôi đã xác định được 52 SSR có liên kết với các tính trạng quan trọng trong chọn giống dưa leo. Điều kiện nhiệt độ bắt cặp tối ưu 46 SSR trong phản ứng PCR khuếch đại DNA dưa leo đã được xác định. Đây là dữ liệu quan trọng cho bước sàng lọc các cây phân ly trong quá trình chọn giống dưa leo tiếp sau đó.

Suggested Citation

  • Lương Hiếu Ngân & Hồ Thị Bích Phượng & Nguyễn Như Thành & Hoàng Thị Thuỳ & Cao Tiến Sang & Vũ Quốc Trưởng & Linh Thị Trúc Lê & Lê Thị Kính, 2021. "Bước đầu xây dựng bộ chỉ thị SSR của DNA dưa leo và nhiệt độ bắt cặp tối ưu của các mồi SSR cho phản ứng PCR," TẠP CHÍ KHOA HỌC ĐẠI HỌC MỞ THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH - KỸ THUẬT VÀ CÔNG NGHỆ, HO CHI MINH CITY OPEN UNIVERSITY JOURNAL OF SCIENCE, HO CHI MINH CITY OPEN UNIVERSITY, vol. 16(1), pages 112-125.
    • Handle: RePEc:bjw:techvi:v:16:y:2021:i:1:p:112-125
    DOI: 10.46223/HCMCOUJS.tech.vi.16.1.1872.2021
    as

    Download full text from publisher

    File URL: https://journalofscience.ou.edu.vn/index.php/tech-vi/article/view/1872/1532
    Download Restriction: no
    File URL: https://libkey.io/10.46223/HCMCOUJS.tech.vi.16.1.1872.2021?utm_source=ideas
    LibKey link: if access is restricted and if your library uses this service, LibKey will redirect you to where you can use your library subscription to access this item
    ---><---

    Corrections

    All material on this site has been provided by the respective publishers and authors. You can help correct errors and omissions. When requesting a correction, please mention this item's handle: RePEc:bjw:techvi:v:16:y:2021:i:1:p:112-125. See general information about how to correct material in RePEc.

    If you have authored this item and are not yet registered with RePEc, we encourage you to do it here. This allows to link your profile to this item. It also allows you to accept potential citations to this item that we are uncertain about.

    We have no bibliographic references for this item. You can help adding them by using this form .

    If you know of missing items citing this one, you can help us creating those links by adding the relevant references in the same way as above, for each refering item. If you are a registered author of this item, you may also want to check the "citations" tab in your RePEc Author Service profile, as there may be some citations waiting for confirmation.

    For technical questions regarding this item, or to correct its authors, title, abstract, bibliographic or download information, contact: Vu Tuan Truong (email available below). General contact details of provider: https://journalofscience.ou.edu.vn/index.php/tech-vi .

    Please note that corrections may take a couple of weeks to filter through the various RePEc services.

    IDEAS is a RePEc service. RePEc uses bibliographic data supplied by the respective publishers.